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保函仲裁（Guarantee Arbitration）是指在国际贸易、工程承包或跨境交易中，当一方（通常为申请人）向银行申请开立保函（如履约保函、预付款保函等）时，保函条款中约定：若受益人与申请人之间因基础合同或保函本身产生争议，应通过仲裁方式解决，而非诉讼。该术语常见于独立保函或见索即付保函中，尤其适用于跨境项目，因仲裁具有保密性、专业性和跨境执行力（依据《纽约公约》）。使用场景包括：国际工程、大宗商品贸易、船舶建造等。注意事项：1）需明确仲裁机构、仲裁地、仲裁规则及适用法律；2）保函的独立性可能导致仲裁与保函索赔程序分离，即银行付款义务不受仲裁结果影响；3）与“保函诉讼”相比，仲裁更灵活但成本可能更高；4）需注意仲裁条款是否有效并入保函。区别：保函仲裁强调争议解决方式，而保函本身是独立担保工具，两者结合时需确保条款清晰，避免因模糊导致执行困难。