衛生検疫（Health and Sanitary Quarantine）とは、国際貿易において伝染病、病害虫および有害生物の国境を越えた拡散を予防するため、出入国検験検疫機関が入国者、交通手段、貨物、コンテナ、手荷物、郵便物などに対して実施する強制的な検査、消毒、隔離または除害処理措置である。使用場面としては、動植物およびその製品、食品、化粧品、廃棄物品などの高リスク貨物を輸入する場合、通関申告前に「入国貨物検験検疫証明」または「衛生検疫証明書」を取得しなければならない。輸出国有が輸入国の要求に応じて検疫を実施し、証明書を発行することもできる。注意事項として、各国の検疫基準は大きく異なり、例えばEUは木質包装材にIPPCマークを要求し、米国は食肉に対して厳格な参入基準を設けている。企業は事前に検疫要件を確認し、証明書の欠如による返送や廃棄を避ける必要がある。「商品検査」とは異なり、衛生検疫は公衆衛生と生物安全に重点を置き、商品検査は品質、規格、数量などの商業的属性に重点を置く。「動植物検疫」と比較すると、衛生検疫は範囲がより広く、人類伝染病の媒介も含む。外国貿易従事者はこれを契約条項に組み込み、責任者と費用負担を明確にすべきである。